Antibody Engineering
抗体工程全流程自动化工作流
安装使用
复制下面这段提示词发给你的 AI（Claude / Cursor / TRAE / Codex / WorkBuddy 等），它会自动帮你完成安装：
帮我安装这个 AI Skill：Antibody Engineering。 它的用途是：抗体工程全流程自动化工作流 完整的 Skill 内容见：https://321skill.com/skills/antibody-engineering-x-4/raw/index.md 请读取该页面内容，如果是 SKILL.md 格式直接安装，如果是 README 提炼核心 prompt 后安装。
提示词包含完整的 Skill 内容链接，AI 读取后即可完成安装。你也可以 查看完整内容 确认无误。
使用示例
'请帮我人源化这个小鼠抗体，序列是QVQLQQSGAELVRPGASVKLSCKAS...，并评估稳定性。' 它会自动调用ANARCI进行Kabat编号，BioPhi进行人源化评分并生成优化序列，IgFold预测结构，最后FoldX和Rosetta计算突变前后的自由能变化，输出含人源化突变建议和稳定性报告的完整文件包。
介绍
抗体工程涉及多个专业工具（ANARCI、BioPhi、IgFold、FoldX、Rosetta），手动切换和学习成本高。本Skill通过SciMiner平台将这些工具整合为一条链，自动完成从抗体序列编号、人源化改造、结构预测到稳定性优化的全部步骤，大幅减少重复操作和人为错误。
使用方式：在SciMiner环境中配置好输入抗体序列（FASTA格式），然后执行本Skill。系统会自动按顺序调用ANARCI进行Kabat/Chothia编号，BioPhi评估人源化潜力并生成优化序列，IgFold预测三维结构，最后FoldX和Rosetta计算突变稳定性并推荐最优变体。整个过程无需用户手动启动各工具或处理中间格式转换。
适合抗体工程研究人员、生物信息学学者、制药公司早期研发团队，以及需要快速对候选抗体进行人源化设计和稳定性评估的高校实验室。也适合希望将重复性抗体设计流程标准化、自动化的AI智能体开发者。
使用前建议：确保输入序列符合抗体可变区格式（VH/VL），并准备至少10分钟的运行时间（因结构预测和能量计算较耗时）。若需批量处理大量抗体，建议在SciMiner中设置并行任务。注意：本Skill不包含细胞实验验证步骤，最终结果需结合湿实验确认。
核心特点
本Skill通过SciMiner将四个专业抗体工程工具（ANARCI、BioPhi、IgFold、FoldX、Rosetta）串联成一个无需手动切换的端到端管线，而其他同类技能通常只封装单个工具或需要用户自行编写流程脚本。
注意事项
不适合非抗体类蛋白质（如酶、受体）的工程任务，且必须运行在SciMiner平台上，无法脱离该环境独立使用。
常见问题
如何安装这个Skill？
在SciMiner市场中搜索“Antibody Engineering”并点击安装，或使用CLI命令：sciminer install antibody-engineering。
支持哪些抗体格式？
支持FASTA格式的抗体可变区序列（VH和VL），也支持IMGT编号的序列。不包含恒定区。
给 AI 助手的安装指引
如果你的 AI 编程助手（Claude Code、Cursor、TRAE 等）能看到这个页面，把下面这段发给它即可自动完成安装：
请访问 https://321skill.com/skills/antibody-engineering-x-4/raw/index.md 读取 Antibody Engineering 的原始 Skill 定义（Markdown 格式），按其中说明在我的环境里完成安装和配置。
AI 可直接读取的原始 Markdown 地址：/skills/antibody-engineering-x-4/raw/index.md（查看排版版本）