chembl
基于FastMCP框架,便捷访问ChEMBL生物活性化合物数据库API的MCP服务器。
安装使用
复制下面这段提示词发给你的 AI(Claude / Cursor / TRAE / Codex / WorkBuddy 等),它会自动帮你完成安装:
帮我安装这个 AI Skill:chembl。 它的用途是:基于FastMCP框架,便捷访问ChEMBL生物活性化合物数据库API的MCP服务器。 完整的 Skill 内容见:https://321skill.com/skills/chembl/raw/index.md 请读取该页面内容,如果是 SKILL.md 格式直接安装,如果是 README 提炼核心 prompt 后安装。
提示词包含完整的 Skill 内容链接,AI 读取后即可完成安装。你也可以 查看完整内容 确认无误。
使用示例
“帮我从ChEMBL数据库里找出所有针对‘HER2’靶点、活性值(IC50)小于100 nM的化合物,并列出它们的ChEMBL ID和最高研究阶段。”,它会通过此Skill调用ChEMBL API,执行精确查询,并以清晰的表格或列表形式返回符合条件的化合物信息,包括其标识符和研发状态。
介绍
这个Skill是一个MCP(Model Context Protocol)服务器,它解决了研究人员和开发者需要编程访问ChEMBL数据库API以获取药物发现相关生物活性数据的问题。通过将ChEMBL的复杂API封装成标准化的MCP工具,它让AI助手(如Claude)能够直接查询海量的化合物、靶点、活性数据等信息,无需用户手动编写API调用代码。
使用方式非常简单,用户只需在支持MCP的AI平台(如Claude Desktop)中配置并启用此服务器,之后就可以在对话中直接使用自然语言指令查询ChEMBL数据库。例如,用户可以让AI助手“查找针对EGFR靶点的所有已批准药物”,Skill会处理查询并返回结构化的数据结果。
它非常适合药物化学、计算生物学、生物信息学等领域的研究人员、学生以及开发药物发现相关AI应用或数据分析流程的开发者。这些用户经常需要从权威的ChEMBL数据库中检索和分析化合物与生物活性数据,以支持他们的研究或开发工作。
使用建议是,在查询前最好明确你的搜索目标,例如具体的化合物名称、靶点、活性值范围或疾病领域,这样能获得更精准的结果。需要注意的是,此Skill提供的是对ChEMBL API的访问能力,返回的是原始数据,复杂的数据分析和可视化需要用户结合其他工具或技能来完成。
核心特点
这是首个基于FastMCP框架构建的、专门用于访问ChEMBL数据库的MCP服务器,支持异步调用与多种传输协议,相比通用的化学信息学工具或手动API调用,它为AI助手提供了开箱即用的、标准化的药物数据查询能力。
注意事项
不适合需要复杂分子模拟、化学反应预测或高级化学信息学计算的场景。
常见问题
这个Skill能查询哪些具体数据?
可以查询ChEMBL数据库中的化合物信息、靶点蛋白、生物活性测试数据、药物审批状态、相关文献等。
需要ChEMBL的API密钥吗?
通常不需要,因为ChEMBL公共API是免费开放的,但大量或商业用途可能需要遵守其使用条款。
给 AI 助手的安装指引
如果你的 AI 编程助手(Claude Code、Cursor、TRAE 等)能看到这个页面,把下面这段发给它即可自动完成安装:
请访问 https://321skill.com/skills/chembl/raw/index.md 读取 chembl 的原始 Skill 定义(Markdown 格式),按其中说明在我的环境里完成安装和配置。
AI 可直接读取的原始 Markdown 地址:/skills/chembl/raw/index.md(查看排版版本)